本发明涉及一种青藏高原多年冻土区植被特性时间变化趋势预测方法，该方法包括以下步骤：S1青藏高原多年冻土区典型样地植物群落特征数据获取和集成；S2青藏高原多年冻土区典型样地空气温度和土壤湿度数据提取及集成整理；S3青藏高原多年冻土区典型样地物种层级植被特性数据整理；S4定义模型通用符号；S5构建基于贝叶斯混合效应模型的青藏高原多年冻土区植被特性时间变化预测模型；S6基于贝叶斯混合效应模型的气候变化背景下植被特性时间变化预测模型实施。本发明可淡化或去除传统方法中存在的主调查区域和时间的影响偏差，能够较客观、精确地预测青藏高原多年冻土区植被特性随变化的趋势。