本申请提供一种多年冻土区工程构筑物自调节支撑系统和自调节方法，涉及寒区工程病害防护领域，支撑系统包括支撑架、控制器和均设于支撑架下方且间隔排布的多个自调节支撑单元，每个自调节支撑单元均包括自调节伸缩器、地基板和压力检测器，自调节伸缩器的两端分别与支撑架和地基板连接，压力检测器安装于地基板的远离自调节伸缩器的一端，压力检测器用于埋设于土体内；自调节伸缩器和压力检测器均与控制器通信连接。该支撑系统通过采用多点柔性支撑的设计方案，能够减小或防治冻土地基差异性变形引发上部结构拉裂缝，保障寒区构筑物的稳定性和安全性。